При изучении неопознанных латающих объектов (НЛО), как и любых других аномальных явлений, всегда возникают трудности, связанные с наблюдением за явлением и дальнейшим анализом полученных данных. Для получения наиболее полных сведений и материалов используется сразу несколько различных методов исследования с подключением к процессу специалистов различных областей наук и применением самых разных приборов. Наиболее доступными методами являются биологический с подключением к исследованию животных как индикаторов среды и магнитометрический метод.
Так, например, в Крыму для получения более точных результатов сейсмопрогнозирования используются данные комплексных показаний феррозондовых и протонных магнитометров, а также параллельно проводится мониторинг аномального поведения животных. Эти же результаты могут использоваться и для обнаружения НЛО, так как, исходя из многочисленных наблюдений НЛО в том же Крыму, выяснилось, что их появление иногда можно предугадать по состоянию геомагнитного поля. Для обоснования данной гипотезы работа в этом направлении продолжается.
Во время пролета НЛО магнитометры неоднократно фиксировали всплески до десятков нанотесла. Это происходило даже тогда, когда сам НЛО визуально наблюдать не удавалось. Подобные наблюдения подтверждают и американские специалисты.
Еще одним индикатором появления НЛО могут выступать животные, птицы и рептилии. Они чувствуют изменения в геомагнитном поле земли и проявляют беспокойство незадолго до появления НЛО.